More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0712 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  100 
 
 
234 aa  473  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
233 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  46.49 
 
 
233 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
233 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
233 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
233 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  46.05 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
233 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
233 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 
225 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
246 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  42.98 
 
 
234 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  43.42 
 
 
234 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 
228 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 
231 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 
231 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 
231 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 
231 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  42.61 
 
 
231 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
231 aa  194  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 
234 aa  194  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
232 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
231 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
237 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 
230 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
230 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 
232 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 
235 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 
230 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  42.41 
 
 
228 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.17 
 
 
229 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
231 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 
233 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 
232 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  41.78 
 
 
230 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 
230 aa  191  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
231 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  41.41 
 
 
233 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
230 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
230 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
231 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
230 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
230 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  41.78 
 
 
230 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
225 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
230 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 
233 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 
228 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.17 
 
 
240 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.61 
 
 
236 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 
234 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 
232 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
232 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 
236 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
232 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 
236 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
232 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
231 aa  185  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
237 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 
234 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 
232 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 
232 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  40.09 
 
 
232 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  39.65 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  38.77 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 
232 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 
232 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 
232 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 
232 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  39.65 
 
 
232 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  42.34 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 
232 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 
236 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  39.65 
 
 
232 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  42.61 
 
 
230 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 
234 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  41.78 
 
 
237 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  42.34 
 
 
234 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  42.22 
 
 
229 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
232 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 
232 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 
234 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  41.89 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  41.89 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  41.85 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>