More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3169 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  68.44 
 
 
228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  66.22 
 
 
228 aa  310  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  59.83 
 
 
233 aa  289  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  58.62 
 
 
246 aa  285  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  60.26 
 
 
233 aa  284  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  58.52 
 
 
233 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  58.52 
 
 
233 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  58.52 
 
 
233 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
233 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
233 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  58.08 
 
 
233 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  58.52 
 
 
233 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  58.08 
 
 
233 aa  281  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
233 aa  280  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  58.7 
 
 
234 aa  280  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
233 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  58.3 
 
 
234 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 
228 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 
228 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  53.91 
 
 
232 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  53.48 
 
 
232 aa  248  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  50 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
234 aa  241  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  50.86 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  48.26 
 
 
232 aa  241  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 
232 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  48.26 
 
 
232 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  50.86 
 
 
234 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 
232 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 
232 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 
232 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 
232 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 
232 aa  232  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 
236 aa  232  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 
232 aa  231  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
232 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
232 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
232 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
232 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
232 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
232 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 
232 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 
232 aa  228  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 
235 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 
237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 
232 aa  221  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
231 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 
232 aa  218  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
231 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
231 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
230 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 
230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  44.39 
 
 
230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 
230 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  44.39 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  44.39 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  44.39 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  44.39 
 
 
230 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  44.39 
 
 
230 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
232 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 
230 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 
229 aa  205  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 
229 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 
229 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
237 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 
231 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 
233 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  46.46 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 
237 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  42.79 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  42.67 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.72 
 
 
234 aa  194  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
230 aa  195  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 
234 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 
232 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 
237 aa  194  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
229 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>