More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  43.72 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  42.42 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  42.37 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  40.77 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  42.86 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.79 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  42.42 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  41.95 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  43.04 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.77 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.72 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  41.7 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  40.69 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.42 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.42 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  43.35 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.42 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.42 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.42 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.42 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.42 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.17 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.98 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  40.69 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  42.49 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  41.81 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  42.36 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  40.34 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  42.49 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>