More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6310 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  93.33 
 
 		 225 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  82.22 
 
 		 225 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.7 
 
 		 225 aa  363  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  82.46 
 
 		 228 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  82.46 
 
 		 228 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  82.46 
 
 		 228 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  82.02 
 
 		 228 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  81.58 
 
 		 228 aa  360  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  80.7 
 
 		 228 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.61 
 
 		 225 aa  353  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  82.67 
 
 		 225 aa  352  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  79.3 
 
 		 229 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  79.3 
 
 		 229 aa  348  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  81.25 
 
 		 225 aa  348  6e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.06 
 
 		 225 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.79 
 
 		 225 aa  345  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0770  winged helix family two component transcriptional regulator  81.25 
 
 		 225 aa  345  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  80.36 
 
 		 225 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 		 238 aa  340  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1076  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.21 
 
 		 228 aa  338  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.85 
 
 		 228 aa  332  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.44 
 
 		 226 aa  332  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  75.78 
 
 		 224 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  79.91 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  76.13 
 
 		 226 aa  329  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.44 
 
 		 227 aa  328  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.44 
 
 		 224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.44 
 
 		 227 aa  325  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  74.43 
 
 		 223 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2332  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.13 
 
 		 227 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0100882  decreased coverage  0.00000063533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  69.16 
 
 		 231 aa  316  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.21 
 
 		 229 aa  315  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  68.16 
 
 		 239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  52.3 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  48.88 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  47.09 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 223 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  49.78 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  45.37 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  45.37 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  50 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  48 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.32 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  49.1 
 
 		 224 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.32 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.32 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.32 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.32 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.32 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.32 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.32 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.32 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 236 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 235 aa  205  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  44.68 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  49.32 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  44.68 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.68 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  44.68 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  44.68 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 226 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>