More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0783 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 242 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.53 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 232 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 243 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 321 aa  198  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  45.18 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  45.18 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  44.69 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  46.12 
 
 		 248 aa  197  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  46.7 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  45.18 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  45.18 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  45.18 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  45.18 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  45.18 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.81 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  45.18 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  45.18 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  47.62 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  47.86 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  47.68 
 
 		 290 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  43.42 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.75 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.43 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  45.69 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.59 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 259 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  47.9 
 
 		 269 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  45.26 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.58 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  45.29 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  45.13 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.88 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  48.02 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>