More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1849 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  85.59 
 
 		 229 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  85.15 
 
 		 229 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.6 
 
 		 225 aa  351  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  78.07 
 
 		 225 aa  349  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.21 
 
 		 261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.73 
 
 		 225 aa  332  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.13 
 
 		 226 aa  330  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  73.68 
 
 		 224 aa  330  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.89 
 
 		 238 aa  329  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  77.73 
 
 		 225 aa  327  7e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.37 
 
 		 224 aa  327  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  77.29 
 
 		 225 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0770  winged helix family two component transcriptional regulator  77.29 
 
 		 225 aa  325  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  72 
 
 		 223 aa  325  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.25 
 
 		 225 aa  320  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  77.09 
 
 		 228 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  77.09 
 
 		 228 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  77.09 
 
 		 228 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.68 
 
 		 226 aa  317  7e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  76.65 
 
 		 225 aa  317  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.8 
 
 		 225 aa  317  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  77.09 
 
 		 225 aa  316  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  76.21 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  75.77 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.04 
 
 		 227 aa  315  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  75.77 
 
 		 228 aa  315  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2332  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.24 
 
 		 227 aa  311  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0100882  decreased coverage  0.00000063533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.42 
 
 		 227 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  73.57 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.24 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1076  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.24 
 
 		 228 aa  305  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  63.88 
 
 		 231 aa  290  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.89 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  53.22 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  51.75 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  51.8 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  50.68 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  49.78 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.77 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  50 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 231 aa  204  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  48.43 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  49.13 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  45.92 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  45.92 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.92 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  45.92 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.92 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  45.92 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  45.92 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.26 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>