More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2658 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  476  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  58.19 
 
 		 234 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  55.36 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  53.39 
 
 		 232 aa  269  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  54.94 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  53.81 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  54.51 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  54.51 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  54.94 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  54.51 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  54.94 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  54.94 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  54.51 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  54.51 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  52.54 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  54.08 
 
 		 233 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  53.65 
 
 		 233 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  56.41 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  56.03 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  56.03 
 
 		 232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  52.84 
 
 		 231 aa  257  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  52.84 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  54.94 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  53.28 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  53.28 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  52.84 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  52.84 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  52.84 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  52.84 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  53.28 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  53.22 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.71 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  52.36 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 		 228 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  51.98 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  51.07 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 232 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  47.44 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  45.73 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  49.57 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.88 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  40.6 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  43.91 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  43.91 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  42.61 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 228 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>