More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1956 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  96.98 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  96.98 
 
 
232 aa  463  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  96.98 
 
 
232 aa  463  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  96.55 
 
 
232 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  95.69 
 
 
232 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  95.69 
 
 
232 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  95.69 
 
 
232 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  93.1 
 
 
232 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 
234 aa  265  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
234 aa  263  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 
232 aa  248  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 
232 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 
232 aa  245  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 
232 aa  245  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 
232 aa  245  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 
233 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  48.05 
 
 
233 aa  244  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 
233 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  47.62 
 
 
233 aa  244  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 
233 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 
233 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  50.88 
 
 
232 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  51.75 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  47.19 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 
233 aa  242  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 
233 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  46.32 
 
 
234 aa  242  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 
232 aa  242  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 
231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
232 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
232 aa  242  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  47.19 
 
 
233 aa  241  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  241  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  241  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  50.65 
 
 
231 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  45.89 
 
 
234 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  51.52 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
228 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  51.08 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
231 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
231 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 
233 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 
228 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  47.39 
 
 
229 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 
246 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  47.86 
 
 
234 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 
228 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  47.44 
 
 
234 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  48.25 
 
 
228 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  50 
 
 
225 aa  223  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 
232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  47.6 
 
 
237 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 
237 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
235 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 
237 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  47.81 
 
 
230 aa  215  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 
237 aa  214  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  46.93 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  46.93 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 
238 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 
229 aa  208  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 
233 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 
225 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
237 aa  204  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
230 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
229 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 
237 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
228 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
232 aa  201  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
239 aa  198  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
239 aa  198  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0041  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 
231 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
229 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
232 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 
232 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 
230 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>