More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1665 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  90.09 
 
 		 235 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  53.04 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  47.81 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  47.16 
 
 		 234 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  48.71 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  48.68 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  48.25 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  48.25 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 234 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 228 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 228 aa  232  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 231 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  45.65 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  47.83 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 232 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  46.05 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 232 aa  224  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  46.05 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1833  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  47.14 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  46.22 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05730  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.81 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.587783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  44.4 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  43.97 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.135137  hitchhiker  0.000253397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>