More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0351 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  82.89 
 
 
230 aa  396  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  81.06 
 
 
229 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  79.74 
 
 
228 aa  384  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  57.46 
 
 
231 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  57.46 
 
 
231 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 
231 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 
231 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  57.46 
 
 
231 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 
231 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 
231 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 
231 aa  255  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  57.02 
 
 
231 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 
232 aa  247  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  53.3 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  52.86 
 
 
233 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  53.3 
 
 
233 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  52.86 
 
 
233 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  53.3 
 
 
233 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  53.3 
 
 
233 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  52.86 
 
 
233 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 
234 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  53.3 
 
 
233 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  52.86 
 
 
233 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  50.88 
 
 
234 aa  224  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  50 
 
 
234 aa  222  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 
233 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 
234 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
246 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
232 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
228 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 
233 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 
232 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 
232 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 
232 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  48.46 
 
 
228 aa  207  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  49.57 
 
 
234 aa  207  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  49.57 
 
 
234 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
232 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  47.35 
 
 
229 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
232 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
232 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
232 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
232 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
232 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  47.6 
 
 
233 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 
232 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  45.85 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
232 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  45.41 
 
 
232 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
232 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  47.79 
 
 
232 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 
232 aa  198  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 
232 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 
232 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 
232 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
223 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
223 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 
228 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
223 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.61 
 
 
223 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 
235 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.73 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
223 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
229 aa  188  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  43.81 
 
 
225 aa  187  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 
223 aa  187  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 
223 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 
233 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 
238 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
230 aa  185  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  40.95 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  44.54 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 
230 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
229 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 
223 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  43.29 
 
 
237 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 
238 aa  181  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 
232 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
237 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 
232 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>