More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1546 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 
238 aa  222  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 
237 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 
229 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.52 
 
 
237 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
229 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  46.52 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 
223 aa  215  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  46.09 
 
 
237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
237 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
237 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
237 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  41.13 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 
231 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
231 aa  209  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 
240 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
233 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
233 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  40.69 
 
 
234 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
233 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  42.42 
 
 
233 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
233 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
233 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  42.42 
 
 
233 aa  208  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
233 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
230 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  42.49 
 
 
240 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  42.49 
 
 
240 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 
233 aa  207  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 
231 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1845  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
234 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.983086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
230 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
230 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 
235 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 
233 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 
246 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 
239 aa  205  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 
239 aa  205  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
232 aa  205  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
228 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
228 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
235 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 
235 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
235 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 
247 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 
227 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 
229 aa  201  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 
235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 
246 aa  201  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  45.22 
 
 
239 aa  201  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 
246 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
231 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 
232 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 
230 aa  201  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
231 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  44.78 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  44.78 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.78 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.78 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  44.78 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  44.78 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  40.26 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40.61 
 
 
229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
235 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40.43 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40.43 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40.43 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40.43 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>