More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1488 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  72.52 
 
 		 236 aa  321  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  72.52 
 
 		 236 aa  321  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  65.64 
 
 		 231 aa  313  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  47.6 
 
 		 227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  48.89 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.54 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.54 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  46.63 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.89 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.64 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  43.61 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  43.17 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 237 aa  177  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.15 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  43.29 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  38.43 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  39.47 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  39.47 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>