More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2933 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  55.84 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  55.84 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 231 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.4 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.4 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  42.54 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  41.36 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.6 
 
 		 243 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2327  two-component response regulator  41.41 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.39 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.96 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.15 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  41.15 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.71 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  39.06 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>