More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0151 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  89.21 
 
 		 240 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.83 
 
 		 240 aa  361  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  77.18 
 
 		 234 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  74.69 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  76.11 
 
 		 252 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.88 
 
 		 238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  74.18 
 
 		 239 aa  324  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  71.84 
 
 		 239 aa  317  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  59.84 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  56.02 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.19 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  54.77 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  48.77 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  53.31 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  47.13 
 
 		 240 aa  224  9e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  47.13 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 234 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 245 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  43.64 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  46.19 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  45.34 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  45.11 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  45.11 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  44.49 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  44.49 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.64 
 
 		 239 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  43.22 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  44.17 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  44.02 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  43.22 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  44.17 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  43.22 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.81 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  44.07 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.68 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  43.64 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  47.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>