More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2179 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 
234 aa  194  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
231 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
236 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.48 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
236 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 
236 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 
237 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 
227 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 
237 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 
237 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 
237 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  37.39 
 
 
237 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 
222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
228 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 
234 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  38.63 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 
232 aa  171  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  37.55 
 
 
230 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  35.62 
 
 
231 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 
231 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 
234 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 
234 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  37.83 
 
 
226 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 
228 aa  168  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 
228 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  36.8 
 
 
227 aa  168  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 
226 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 
245 aa  168  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 
231 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 
231 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  37.28 
 
 
229 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  35.62 
 
 
230 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 
231 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 
231 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  36.96 
 
 
228 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 
231 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 
226 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 
238 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 
228 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 
230 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  35.34 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 
229 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.99 
 
 
230 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 
227 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 
242 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 
228 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  35.78 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.99 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  36.05 
 
 
230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 
234 aa  164  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 
232 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.91 
 
 
231 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 
227 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 
237 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
229 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 
230 aa  164  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  36.64 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  36.05 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.39 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  34.91 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  35.81 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  36.05 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1845  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
234 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.983086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  36.21 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>