More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4069 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4069  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0969233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8764  response regulator receiver protein  67.11 
 
 		 229 aa  294  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.08 
 
 		 234 aa  287  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4194  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.92 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100781  normal  0.264432 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.25 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  46.22 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 231 aa  201  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.98 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.98 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  48.66 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  46.7 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.35 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  46.85 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.22 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 226 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.19 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.39 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.98 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  47.79 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.9 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.7 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 250 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  47.75 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.98 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.05 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.67 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  43.42 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  43.11 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  43.11 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.11 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>