More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4234 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  100 
 
 		 469 aa  947    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  33.81 
 
 		 717 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  59.8 
 
 		 323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0794  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  37.28 
 
 		 724 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  50.81 
 
 		 945 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  33.47 
 
 		 1005 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.64 
 
 		 590 aa  93.2  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  26.83 
 
 		 774 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  36.81 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  42.59 
 
 		 619 aa  86.7  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  36.49 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.73 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.82 
 
 		 444 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.13 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  37.98 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  35.42 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  25.61 
 
 		 1066 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  35.22 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  35.42 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  36.55 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  37.5 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  32.34 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.94 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.53 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.96 
 
 		 1065 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  32.2 
 
 		 277 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  31.74 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  31.74 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  34.27 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  26.11 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.96 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.53 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  32.34 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.72 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  25.17 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  31.36 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  31.74 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.64 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  25.92 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.13 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  35.86 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  31.95 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  31.95 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.64 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  29.95 
 
 		 1010 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.99 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  31.95 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  31.95 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  31.36 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.94 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  29.83 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34.33 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.99 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  34.59 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  34.11 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  28.29 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  40.35 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  28.16 
 
 		 1060 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  28.29 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  28.29 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  28.29 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  35.38 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  28.29 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  36.92 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  37.4 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.26 
 
 		 1062 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  30.91 
 
 		 276 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.61 
 
 		 1062 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.83 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.86 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.94 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  25.74 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  29.56 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  27.18 
 
 		 1067 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  27.18 
 
 		 1081 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.26 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.23 
 
 		 1090 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  33.33 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  27.65 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  27.65 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  33.99 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.26 
 
 		 1062 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  30.38 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  31.29 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  26.25 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  32.17 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  31.61 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 658 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>