More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02602 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  47.32 
 
 		 774 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  100 
 
 		 772 aa  1541    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  28.1 
 
 		 717 aa  171  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  24.27 
 
 		 729 aa  121  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1209  winged helix family two component response transcriptional regulator  23.16 
 
 		 714 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310847  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  25.96 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  27.09 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  21.54 
 
 		 711 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  21.31 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.69 
 
 		 514 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  21.23 
 
 		 762 aa  79  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2820  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.69 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0342818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2758  DNA-binding transcriptional activator CadC  26.69 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  23.91 
 
 		 700 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3769  DNA-binding transcriptional activator CadC  31.02 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000389639  normal  0.0128814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 		 969 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3061  transcriptional regulator domain-containing protein  23.55 
 
 		 716 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0196528  hitchhiker  0.000417149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  23.62 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  25.07 
 
 		 756 aa  75.5  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2713  transcriptional activator CadC  35.05 
 
 		 395 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  19.25 
 
 		 725 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.28 
 
 		 428 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  32.11 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  32.11 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  32.11 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  32.11 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  32.11 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  32.11 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  32.73 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.5 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  31.19 
 
 		 512 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  26.62 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.33 
 
 		 434 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.24 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.62 
 
 		 1062 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1101  transcriptional regulator domain-containing protein  22.46 
 
 		 713 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000631181  hitchhiker  0.00725129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  24.6 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2965  transcriptional regulator domain-containing protein  23.85 
 
 		 716 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00199161  normal  0.0124128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  28.57 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  29.47 
 
 		 450 aa  66.6  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  21.64 
 
 		 711 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  37.5 
 
 		 693 aa  65.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  26.6 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  26.07 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  26.54 
 
 		 1090 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  28.12 
 
 		 432 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.76 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  23.93 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.64 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.35 
 
 		 1005 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  27.76 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  23.93 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  25.86 
 
 		 918 aa  62  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  25.09 
 
 		 438 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.74 
 
 		 415 aa  62  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  26.42 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  30.09 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.19 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.24 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  28.14 
 
 		 419 aa  60.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  25.63 
 
 		 451 aa  60.1  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.72 
 
 		 362 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  26.42 
 
 		 430 aa  60.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.04 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.74 
 
 		 1082 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  24.77 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  34.31 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.56 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.92 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  28.57 
 
 		 1060 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.23 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  27.54 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 1092 aa  58.9  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 		 734 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  28.92 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  30.86 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.16 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.35 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.13 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>