More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1631 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  683    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  74.14 
 
 		 348 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1447  WD40 domain protein beta Propeller  39.19 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000967065  normal  0.55523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  32.52 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.36 
 
 		 717 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.97 
 
 		 1028 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.92 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  27.05 
 
 		 901 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.02 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  30.7 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  27.17 
 
 		 1090 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.09 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  30.7 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  25.85 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  29.95 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  28.18 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 		 969 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  25.89 
 
 		 427 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  29.52 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  29.07 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.32 
 
 		 1062 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.28 
 
 		 567 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  28.45 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  25.47 
 
 		 1069 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  29.71 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  25.94 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  30.32 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.53 
 
 		 1066 aa  62.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  27.92 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.06 
 
 		 1081 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  29.05 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  29.61 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.71 
 
 		 1082 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.94 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  27.18 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.59 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.05 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  26.47 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  25.3 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  24.53 
 
 		 1062 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  22.57 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  26.47 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.91 
 
 		 687 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  24.15 
 
 		 1060 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  24.53 
 
 		 1062 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  24.53 
 
 		 1062 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  24.53 
 
 		 1062 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.54 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  33.62 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.24 
 
 		 1065 aa  60.1  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  25.85 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.46 
 
 		 720 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  26.96 
 
 		 970 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  25.33 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.11 
 
 		 674 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  23.18 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  25 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  22.12 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  24.53 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  28.74 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  23.29 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.4 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.64 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  23.29 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  25.33 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  23.29 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  23.29 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  24.06 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  28.32 
 
 		 1042 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  26.01 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  24.49 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  24.06 
 
 		 1062 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  24.79 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  25.35 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  24.37 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  23.29 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  23.44 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  24.05 
 
 		 434 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.81 
 
 		 677 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25 
 
 		 1067 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.93 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  27.21 
 
 		 1016 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.89 
 
 		 1062 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.67 
 
 		 1348 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 439 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>