More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1133 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  97.21 
 
 		 430 aa  823    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  100 
 
 		 430 aa  863    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  46.96 
 
 		 449 aa  348  8e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  43.86 
 
 		 340 aa  236  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  35.48 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  36.25 
 
 		 438 aa  206  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  36.36 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  35.64 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  34.17 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  35.64 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  34.17 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  35.4 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  35.4 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  32.95 
 
 		 424 aa  200  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  35.15 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.8 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  33.25 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  32.65 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  33.78 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  33.58 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  33.25 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.72 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  33 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  30.52 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  37.54 
 
 		 421 aa  193  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  36.01 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  34.41 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  34.24 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  32 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  36.01 
 
 		 474 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  36.84 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  34 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  34 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  34.08 
 
 		 414 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  32.91 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.19 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  32.51 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  32.51 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  33.03 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  31.42 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  31.89 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  31.69 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.42 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.42 
 
 		 437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31 
 
 		 436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  31.19 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  32.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  32.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  32.36 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  32.36 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34.87 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  35.16 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.26 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 451 aa  179  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  31.03 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  31.88 
 
 		 441 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.71 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  31.03 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  31.98 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  31.78 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  38.41 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.81 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  30.97 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  31.19 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  32.64 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.64 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  30.97 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  30.75 
 
 		 442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  30.97 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  30.97 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  30.66 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.53 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  32.96 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  30.79 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  32.66 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>