More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0446 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 340 aa  685    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  44.56 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  44.21 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0397  hypothetical protein  84.21 
 
 		 115 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  39.5 
 
 		 449 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34.89 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  34.89 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32.76 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 430 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.59 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.65 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.71 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 446 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  35.1 
 
 		 430 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 432 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  33.47 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  33.57 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  33.57 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  30.3 
 
 		 433 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 433 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.9 
 
 		 434 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  30.22 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 421 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.9 
 
 		 434 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  33.47 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  33.47 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  30.58 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.05 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  33.89 
 
 		 439 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 432 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  31.77 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  34.41 
 
 		 431 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.23 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  30.96 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  31.45 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.58 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  29.9 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  32.73 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.94 
 
 		 428 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  33.6 
 
 		 463 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  33.6 
 
 		 431 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  32.9 
 
 		 434 aa  112  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  29.93 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  33.06 
 
 		 430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  33.06 
 
 		 463 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  33.06 
 
 		 430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  33.6 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  32.66 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  32.79 
 
 		 463 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  32.66 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  32.66 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  31.23 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  34.31 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.88 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.37 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  33.89 
 
 		 439 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  30.32 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  30.32 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  29.45 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  28.52 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.79 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  27.96 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  27.86 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.86 
 
 		 442 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  30.99 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.86 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.67 
 
 		 446 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.92 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.69 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  28.11 
 
 		 442 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.28 
 
 		 442 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 444 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.08 
 
 		 445 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 462 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  26.64 
 
 		 450 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.8 
 
 		 446 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.8 
 
 		 446 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.29 
 
 		 461 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.55 
 
 		 454 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.91 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.76 
 
 		 449 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 451 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  31.29 
 
 		 450 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.8 
 
 		 446 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.64 
 
 		 442 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  30.7 
 
 		 461 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.14 
 
 		 441 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  29.05 
 
 		 451 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  30.14 
 
 		 442 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  27.96 
 
 		 450 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>