More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1569 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  909    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  48.58 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  48.84 
 
 		 430 aa  345  8e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.23 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.11 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.5 
 
 		 424 aa  140  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  30.37 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.09 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.38 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  27.53 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.2 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 436 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.09 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.46 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  28.18 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.37 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.37 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  25.92 
 
 		 430 aa  124  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  26.36 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.54 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  26.57 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.73 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  26.57 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.07 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.65 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  27.82 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  27.89 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  26.57 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.77 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  27.42 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.22 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.26 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  26.62 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  26.25 
 
 		 442 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  27.63 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  27.33 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  27.58 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.76 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 446 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  28.82 
 
 		 439 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.21 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  25.81 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  25.53 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  28.74 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  25.81 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.45 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  25.24 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  24.02 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25.54 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  28.53 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  27.36 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  27.36 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  25.68 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  25.82 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.73 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.02 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.95 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.95 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  27.81 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  26.12 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.94 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.06 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.33 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.68 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  26.8 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  25.22 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  26.73 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  26.49 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  26.65 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  26.97 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  25.28 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  25.51 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  27.89 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  24.77 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.51 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  26.68 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  26.67 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  25.9 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  27.41 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.36 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>