More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1627 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1250    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  41.99 
 
 		 675 aa  359  8e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  44.81 
 
 		 669 aa  349  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  52.02 
 
 		 679 aa  346  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  51.11 
 
 		 685 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  57.37 
 
 		 713 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  56 
 
 		 752 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  64.52 
 
 		 581 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  65.08 
 
 		 1882 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  65.08 
 
 		 1300 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  66.13 
 
 		 1682 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  66.4 
 
 		 2036 aa  324  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  65.99 
 
 		 1120 aa  323  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  65.18 
 
 		 1969 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  63.89 
 
 		 791 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  66.8 
 
 		 735 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  63.89 
 
 		 1842 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  64.37 
 
 		 547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  62.35 
 
 		 1241 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  63.71 
 
 		 2272 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  64.12 
 
 		 551 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  65.2 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  64.23 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  63.82 
 
 		 978 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  62.55 
 
 		 2122 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  63.41 
 
 		 2000 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  64.23 
 
 		 859 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  53.87 
 
 		 1094 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  62.72 
 
 		 658 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  47.35 
 
 		 560 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  55.2 
 
 		 1667 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  77.51 
 
 		 644 aa  273  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  56.52 
 
 		 3295 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.71 
 
 		 910 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  53.75 
 
 		 1732 aa  259  7e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  53.23 
 
 		 1356 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  49.48 
 
 		 1361 aa  258  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 528 aa  256  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  48.94 
 
 		 1236 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  50.6 
 
 		 1862 aa  246  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  48.55 
 
 		 1282 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.62 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.91 
 
 		 930 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  48.03 
 
 		 2554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.29 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  49.4 
 
 		 838 aa  231  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  49.4 
 
 		 963 aa  228  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  66.46 
 
 		 184 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.77 
 
 		 958 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  43.8 
 
 		 941 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  48.98 
 
 		 861 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.25 
 
 		 1667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.62 
 
 		 930 aa  198  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.35 
 
 		 971 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  39.48 
 
 		 1528 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.91 
 
 		 840 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  54.02 
 
 		 519 aa  184  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  38.85 
 
 		 439 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.83 
 
 		 869 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45.53 
 
 		 1095 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.52 
 
 		 1387 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.64 
 
 		 2552 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  43.46 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 		 786 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.15 
 
 		 1292 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.08 
 
 		 1783 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 		 823 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 719 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.64 
 
 		 870 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.63 
 
 		 802 aa  173  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.16 
 
 		 777 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  35.31 
 
 		 938 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.49 
 
 		 845 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.04 
 
 		 819 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  41.49 
 
 		 1531 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.56 
 
 		 1189 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  42.06 
 
 		 929 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  36.23 
 
 		 952 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  36.46 
 
 		 769 aa  157  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  38.95 
 
 		 1011 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.06 
 
 		 1380 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.19 
 
 		 500 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  48.19 
 
 		 1231 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  40.78 
 
 		 821 aa  150  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  48.62 
 
 		 1328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  46.07 
 
 		 816 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  39.81 
 
 		 848 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  39.02 
 
 		 1814 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  39.26 
 
 		 2176 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  47.27 
 
 		 1931 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  42.34 
 
 		 996 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  44.04 
 
 		 1311 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  38.58 
 
 		 408 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  39.29 
 
 		 1620 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 		 684 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  39.52 
 
 		 1987 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  36.26 
 
 		 865 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  37.11 
 
 		 1602 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  47.56 
 
 		 940 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.76 
 
 		 395 aa  125  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>