191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1447 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1447  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 
325 aa  634    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000967065  normal  0.55523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  39.19 
 
 
347 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  39.42 
 
 
348 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  27.48 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  25.4 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  27.56 
 
 
901 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  27.21 
 
 
461 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.64 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.39 
 
 
425 aa  59.3  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  34.12 
 
 
451 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  30.29 
 
 
674 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27440  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  54.55 
 
 
681 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  25.91 
 
 
431 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  26.32 
 
 
432 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.88 
 
 
463 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.52 
 
 
674 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  28.97 
 
 
439 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  25.91 
 
 
431 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  25.31 
 
 
438 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  34.45 
 
 
444 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  25.91 
 
 
431 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  25.91 
 
 
431 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.52 
 
 
674 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  25.22 
 
 
567 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  25.91 
 
 
431 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.46 
 
 
1090 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  25.91 
 
 
431 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  27.88 
 
 
463 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  27.88 
 
 
463 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  27.88 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  33.61 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  25.41 
 
 
629 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  23.43 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.84 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  31.43 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  31.13 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  27.88 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  33.61 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  27.88 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  27.88 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  27.88 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  37.5 
 
 
1079 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  28.32 
 
 
454 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.3 
 
 
441 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.64 
 
 
1082 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  33.75 
 
 
430 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  32.18 
 
 
430 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  25.97 
 
 
450 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  28.51 
 
 
422 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.51 
 
 
422 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  38.64 
 
 
461 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.06 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.7 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  31.78 
 
 
439 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  33.06 
 
 
1016 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.31 
 
 
667 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  45.83 
 
 
1042 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.09 
 
 
497 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  25.85 
 
 
434 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  28.09 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.41 
 
 
440 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.41 
 
 
443 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  32.52 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
642 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  39.39 
 
 
509 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.01 
 
 
1113 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  44.44 
 
 
1040 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  35.62 
 
 
1066 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.44 
 
 
615 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  26.43 
 
 
1138 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  35.44 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  44.44 
 
 
1042 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.17 
 
 
717 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  21.45 
 
 
451 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  33.33 
 
 
277 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  25.75 
 
 
572 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.73 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  25.51 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.58 
 
 
446 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 
721 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  25.1 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  22.3 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  26.19 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.21 
 
 
1059 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.63 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  31.17 
 
 
450 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  32.35 
 
 
469 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  35.62 
 
 
1060 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  46.03 
 
 
648 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.49 
 
 
709 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1471  hypothetical protein  28.36 
 
 
311 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00493509  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  23.11 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  25.88 
 
 
445 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  31.37 
 
 
441 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  36.25 
 
 
354 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3857  WD40 domain protein beta Propeller  38.18 
 
 
290 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4943  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  37.5 
 
 
618 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.25 
 
 
436 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  36.71 
 
 
1076 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
969 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>