More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3769 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3769  DNA-binding transcriptional activator CadC  100 
 
 		 518 aa  1074    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000389639  normal  0.0128814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2820  DNA-binding transcriptional activator CadC  54.46 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0342818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  54.26 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  54.26 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2758  DNA-binding transcriptional activator CadC  54.46 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00262539  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  58.38 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  58.57 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.38 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.57 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  58.38 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.57 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.38 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  58.57 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2713  transcriptional activator CadC  53.57 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2716  transcriptional activator CadC  57.81 
 
 		 133 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2656  DNA-binding transcriptional activator CadC  25.92 
 
 		 541 aa  156  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00207  DNA-binding transcriptional activator CadC  24.95 
 
 		 523 aa  153  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2494  DNA-binding transcriptional activator CadC  25.19 
 
 		 542 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002187  transcriptional activator of cad operon  24.95 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000411708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  41 
 
 		 717 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  27.76 
 
 		 774 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  35.4 
 
 		 1074 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 712 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  31.02 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  41.18 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3319  transcriptional regulatory protein-like protein  38.71 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.389048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  35.35 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  35.92 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  32.46 
 
 		 1102 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  24.66 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  26.34 
 
 		 729 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0992  winged helix family two component response transcriptional regulator  35.51 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 1092 aa  67.4  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 1020 aa  67  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  37.21 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  35.58 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  37.37 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  30.84 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1569  winged helix family two component response transcriptional regulator  34 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000954897  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  31.25 
 
 		 1092 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  40.21 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  28.89 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  30.36 
 
 		 1089 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1712  transcriptional regulator, putative  29.9 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  30.36 
 
 		 1089 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  30.36 
 
 		 1075 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 1075 aa  63.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.53 
 
 		 1075 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  32.17 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.53 
 
 		 1063 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 1080 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  31.03 
 
 		 1067 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.34 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 242 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 242 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  38 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1209  winged helix family two component response transcriptional regulator  34.38 
 
 		 714 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310847  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  31.25 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  31.48 
 
 		 711 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  46.75 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 956 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.45 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2898  cholera toxin transcriptional activator-like protein  28.78 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.398883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  25.95 
 
 		 1124 aa  60.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  30.7 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1311  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  34 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  46.75 
 
 		 292 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.7 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  30.7 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  26.96 
 
 		 716 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2965  transcriptional regulator domain-containing protein  26.96 
 
 		 716 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00199161  normal  0.0124128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  42.7 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.98 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  29.59 
 
 		 977 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.69 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  29.75 
 
 		 499 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  29 
 
 		 223 aa  57  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 330 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 953 aa  57  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 959 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 231 aa  57  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  35.05 
 
 		 223 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>