More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08230 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 918 aa  1875    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.42 
 
 		 970 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.1 
 
 		 976 aa  275  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  26.98 
 
 		 956 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  25.33 
 
 		 901 aa  252  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1021 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  27.05 
 
 		 1078 aa  221  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  27.45 
 
 		 1077 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  29.98 
 
 		 1206 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  28.12 
 
 		 881 aa  213  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  24.85 
 
 		 970 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.54 
 
 		 1028 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0824  hypothetical protein  24.14 
 
 		 814 aa  107  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  22.6 
 
 		 979 aa  95.9  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  20.97 
 
 		 977 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  24.8 
 
 		 1060 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  20.77 
 
 		 947 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.17 
 
 		 1078 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.51 
 
 		 1005 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  23.21 
 
 		 982 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.46 
 
 		 717 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.41 
 
 		 407 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  28.49 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.35 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.05 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.5 
 
 		 407 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.05 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 		 292 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.66 
 
 		 446 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  29.13 
 
 		 1097 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  34.69 
 
 		 450 aa  70.1  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  22.66 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.08 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  23.72 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1234  trep  21.89 
 
 		 924 aa  68.2  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  31.86 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0538  hypothetical protein  25.51 
 
 		 885 aa  67  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000796497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  29.46 
 
 		 437 aa  67.4  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.12 
 
 		 440 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  25.21 
 
 		 354 aa  67.4  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  29.46 
 
 		 440 aa  67.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.26 
 
 		 1014 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.82 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  26.11 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.27 
 
 		 1090 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 969 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  25.51 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1792  hypothetical protein  22.38 
 
 		 836 aa  65.1  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.201909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.37 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  32.26 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  21.24 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.79 
 
 		 1059 aa  64.3  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 428 aa  64.3  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  31.85 
 
 		 474 aa  64.3  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.88 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  22.83 
 
 		 1076 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  22.83 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.88 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.19 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  22.73 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  24.27 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.29 
 
 		 1082 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  25.23 
 
 		 439 aa  62  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  23.98 
 
 		 430 aa  62  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  25.86 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.19 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1427  hypothetical protein  20.68 
 
 		 936 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  24.2 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  24.63 
 
 		 441 aa  60.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  23.5 
 
 		 442 aa  60.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  23.81 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.7 
 
 		 1071 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  24.92 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.88 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  22.55 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  23.53 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  23.36 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  27.22 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6241  hypothetical protein  20.35 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  26.8 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  28.16 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  25.2 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.92 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  27.96 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  23.96 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.45 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  28.47 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  23.65 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  23.65 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  23.65 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  33.77 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  25.83 
 
 		 1078 aa  57.8  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1733  hypothetical protein  21.81 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.79 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.77 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2270  hypothetical protein  20.56 
 
 		 1010 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.122656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>