More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0794 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0794  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 724 aa  1474    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 862 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  34.23 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  42.86 
 
 		 323 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  41.72 
 
 		 945 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  40 
 
 		 619 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  22.95 
 
 		 717 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  37.38 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 658 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  32.18 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  29.18 
 
 		 729 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3319  transcriptional regulatory protein-like protein  34.38 
 
 		 691 aa  66.6  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.389048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  36 
 
 		 977 aa  65.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  31.34 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  36.08 
 
 		 1010 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  34.48 
 
 		 245 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  23.04 
 
 		 969 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.79 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.79 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 959 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  36.19 
 
 		 711 aa  60.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  25.34 
 
 		 1071 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  36.71 
 
 		 290 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  31.9 
 
 		 413 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  31.9 
 
 		 413 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 591 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.9 
 
 		 413 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  24.55 
 
 		 240 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  26.17 
 
 		 352 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1101  transcriptional regulator domain-containing protein  23.41 
 
 		 713 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000631181  hitchhiker  0.00725129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 1001 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 231 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  32.65 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 954 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0821  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.321247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  23.98 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  32.35 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  32.08 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0798  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  27.64 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.48 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  28.42 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.69 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  32.08 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  31.31 
 
 		 1131 aa  57.4  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  33.96 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.05 
 
 		 251 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.16 
 
 		 232 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.04 
 
 		 229 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 1092 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 234 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 225 aa  57  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  28.42 
 
 		 233 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  28.42 
 
 		 234 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  28.42 
 
 		 234 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  32.08 
 
 		 243 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  28.42 
 
 		 234 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  28.42 
 
 		 234 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  28.42 
 
 		 234 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.81 
 
 		 567 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  30.48 
 
 		 504 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  29.29 
 
 		 1102 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  27.72 
 
 		 234 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 1080 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  31.4 
 
 		 233 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  31.4 
 
 		 233 aa  55.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  31.4 
 
 		 233 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  28.12 
 
 		 409 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 972 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  31.4 
 
 		 233 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 237 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  36.08 
 
 		 231 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  33.96 
 
 		 243 aa  55.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.66 
 
 		 415 aa  55.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 235 aa  55.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  30.19 
 
 		 240 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6015  two component transcriptional regulator  35.05 
 
 		 240 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 227 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 227 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  31.4 
 
 		 233 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>