More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3933 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 298 aa  617  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.1 
 
 		 430 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  35.17 
 
 		 435 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  34.62 
 
 		 429 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.91 
 
 		 427 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  37.75 
 
 		 432 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.05 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30.47 
 
 		 443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  30.99 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.79 
 
 		 440 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.34 
 
 		 407 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.77 
 
 		 407 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.99 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  30.33 
 
 		 449 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.47 
 
 		 440 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  31.33 
 
 		 444 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.21 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  31.38 
 
 		 620 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  36.79 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  31.8 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  28.52 
 
 		 717 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.62 
 
 		 572 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.17 
 
 		 567 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  32.6 
 
 		 454 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 969 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  29.51 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.05 
 
 		 450 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  33.51 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  34.36 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.66 
 
 		 667 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  30.25 
 
 		 434 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  34.27 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  30.42 
 
 		 434 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  32.24 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  32.24 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  32.98 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  30.42 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 642 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  32.99 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  32.42 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.69 
 
 		 445 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.88 
 
 		 415 aa  99.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  32.24 
 
 		 451 aa  99.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.06 
 
 		 438 aa  99  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.97 
 
 		 441 aa  99  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  28.93 
 
 		 439 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.15 
 
 		 450 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.02 
 
 		 441 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.05 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.05 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.1 
 
 		 442 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 646 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  25.1 
 
 		 437 aa  96.3  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.57 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  32.57 
 
 		 437 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  26.96 
 
 		 416 aa  95.9  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  32.24 
 
 		 462 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  27.61 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.02 
 
 		 446 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.47 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  24.32 
 
 		 354 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.02 
 
 		 446 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  29.41 
 
 		 430 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.57 
 
 		 446 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.84 
 
 		 448 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.05 
 
 		 446 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  30.05 
 
 		 430 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.76 
 
 		 434 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.49 
 
 		 461 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.09 
 
 		 432 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  31.69 
 
 		 450 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.93 
 
 		 446 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.35 
 
 		 395 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  27.76 
 
 		 434 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 428 aa  92.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 		 367 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.67 
 
 		 445 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 443 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  26.94 
 
 		 436 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.54 
 
 		 446 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 450 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 450 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  25.86 
 
 		 428 aa  89.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 443 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.29 
 
 		 427 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  31.49 
 
 		 629 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  26.42 
 
 		 453 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  27.8 
 
 		 615 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  29.02 
 
 		 451 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  29.9 
 
 		 469 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  27.91 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  25.96 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.24 
 
 		 660 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  24.38 
 
 		 357 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.61 
 
 		 441 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.58 
 
 		 426 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>