More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1429 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  100 
 
 		 313 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  56.25 
 
 		 275 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  55.88 
 
 		 276 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  52.82 
 
 		 497 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  51.28 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  53.45 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  52.55 
 
 		 509 aa  298  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  49.64 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  46.44 
 
 		 518 aa  281  9e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  38.81 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0570  hypothetical protein  36 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0247  hypothetical protein  34.91 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0475  hypothetical protein  32.9 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  38.26 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  34.23 
 
 		 437 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.5 
 
 		 461 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.88 
 
 		 421 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  31.66 
 
 		 642 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.58 
 
 		 440 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  37.04 
 
 		 443 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  29.38 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  31 
 
 		 451 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  36.91 
 
 		 426 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  31.41 
 
 		 408 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  35.57 
 
 		 441 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  31.5 
 
 		 454 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  29.52 
 
 		 429 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 425 aa  86.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  36.49 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.55 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  36.49 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  34.21 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.55 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.21 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  27.23 
 
 		 1005 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  41.75 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  41.75 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  41.75 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  41.75 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  40.78 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.21 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.89 
 
 		 434 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.78 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.3 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.04 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.6 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.1 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  35.82 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.89 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.03 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  31.54 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  25.65 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  24.88 
 
 		 572 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 430 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  24.55 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 646 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  32.37 
 
 		 1193 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.51 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  39.42 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.41 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  24.22 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  33.11 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  29.9 
 
 		 1097 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.97 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  32.88 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  31.13 
 
 		 419 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  31.13 
 
 		 419 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 444 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  35.53 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  34.29 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.14 
 
 		 421 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28.72 
 
 		 445 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.03 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  30.38 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.41 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  24.05 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.81 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.2 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.19 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.78 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  28.68 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  33.56 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>