More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2220 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 275 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  93.07 
 
 		 276 aa  533  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  70.65 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  56.25 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  49.82 
 
 		 497 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  47.1 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  45.94 
 
 		 518 aa  241  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  43.91 
 
 		 509 aa  231  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  42.7 
 
 		 512 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  42.11 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0570  hypothetical protein  40.07 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0247  hypothetical protein  39.3 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0475  hypothetical protein  32.74 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.12 
 
 		 427 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 454 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.84 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.87 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  29.67 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30.27 
 
 		 443 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.5 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  34.12 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 438 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.8 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.41 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  29.24 
 
 		 717 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.32 
 
 		 445 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  33.53 
 
 		 435 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  28.17 
 
 		 1097 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.39 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 		 646 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  28.28 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.94 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.58 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.06 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  28.28 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 437 aa  72  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  27 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  33.33 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  25.27 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.41 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  29.29 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.4 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.24 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  26.79 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  28.65 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 443 aa  68.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  33.68 
 
 		 1082 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  26.25 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.4 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.06 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.65 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.73 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  28.79 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.68 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.06 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.3 
 
 		 1010 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 421 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  29.21 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  27.08 
 
 		 428 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  28.66 
 
 		 1005 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  27.7 
 
 		 442 aa  67  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.19 
 
 		 428 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  25.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  25.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  27.09 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  26.6 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  37.01 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.69 
 
 		 567 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  31.03 
 
 		 419 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  43.9 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  27.69 
 
 		 441 aa  65.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  25.09 
 
 		 1069 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  34.09 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  28.35 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.26 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.81 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  32.26 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  27.69 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.11 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  33.56 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>