More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2002 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  93.07 
 
 		 275 aa  533  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  68.95 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  55.88 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  49.82 
 
 		 497 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  46.38 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  47.35 
 
 		 518 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  43.43 
 
 		 512 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  43.93 
 
 		 509 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  43.16 
 
 		 408 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0570  hypothetical protein  40.78 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0247  hypothetical protein  38.95 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0475  hypothetical protein  33.23 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 454 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.04 
 
 		 427 aa  85.5  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  32.42 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.77 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  34.52 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.81 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30.04 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.8 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.37 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.58 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.94 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.14 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  31.84 
 
 		 717 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  28.97 
 
 		 1097 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.86 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  30.91 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.29 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.29 
 
 		 442 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.32 
 
 		 442 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.82 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 646 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.81 
 
 		 441 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 443 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.16 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.39 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  28.9 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  29.38 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.65 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.65 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  30.15 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  26.18 
 
 		 1069 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  30.15 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  38.33 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  36.89 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  30.56 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  30.1 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  30.16 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  26.96 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  27.14 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  28.8 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  29.17 
 
 		 1005 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  38.02 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  29.61 
 
 		 1010 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.4 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.14 
 
 		 434 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  28.88 
 
 		 421 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  27.14 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  29.12 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 421 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 414 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  27.69 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  26.32 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  35.21 
 
 		 425 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  29.15 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  34.78 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  25.54 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  29.32 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1081 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.06 
 
 		 567 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.72 
 
 		 415 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  33.11 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.16 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.65 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.82 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  28.19 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  36.07 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  26.98 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  25.58 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.62 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  32.68 
 
 		 1082 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  26.47 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  29.81 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1066 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  28.14 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.22 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.14 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>