More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3121 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 
409 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  81.8 
 
 
436 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  78.03 
 
 
413 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  78.03 
 
 
413 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  78.03 
 
 
413 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
361 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  53.26 
 
 
540 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  37.53 
 
 
413 aa  262  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
352 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  43.17 
 
 
363 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  35.77 
 
 
396 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  35.77 
 
 
396 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  35.17 
 
 
396 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 
352 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  38.41 
 
 
514 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  39.43 
 
 
518 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  54.46 
 
 
522 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  51.04 
 
 
521 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  46.77 
 
 
521 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  55 
 
 
531 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  50.52 
 
 
522 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  36.76 
 
 
425 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
283 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 
516 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.02 
 
 
261 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  48 
 
 
525 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
263 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 
256 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
279 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 
267 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.46 
 
 
263 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 
261 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
273 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  30.48 
 
 
269 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  32.23 
 
 
302 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
270 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.9 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  28.78 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
278 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.4 
 
 
279 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
267 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
271 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  28.52 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  36.84 
 
 
527 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.52 
 
 
273 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
280 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 
261 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.09 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.28 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
266 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.9 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.76 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.1 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  34.75 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.08 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 
270 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  24.73 
 
 
296 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
282 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.19 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  30.74 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.01 
 
 
272 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24.45 
 
 
296 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.36 
 
 
296 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  25.43 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>