271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4853 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
289 aa  587  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  39.79 
 
 
306 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 
320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 
302 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  36.82 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  39.42 
 
 
295 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  33.8 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  32.4 
 
 
308 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  29.69 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  34.51 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  32.75 
 
 
304 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 
304 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 
310 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  28.15 
 
 
294 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  28.63 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  39.85 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 
1392 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  39.84 
 
 
471 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  39.84 
 
 
468 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  33.49 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
481 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
1160 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  26.05 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  31.49 
 
 
1093 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.83 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 
536 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.14 
 
 
1226 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  36.08 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  37.21 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  38.4 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.56 
 
 
643 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.43 
 
 
971 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.96 
 
 
577 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  37.98 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  43.3 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  33.61 
 
 
667 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  30.41 
 
 
603 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
647 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 
645 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  38.54 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 
859 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.61 
 
 
513 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  36.29 
 
 
411 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
355 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  40.4 
 
 
336 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  33.76 
 
 
378 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 
425 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.13 
 
 
1089 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  42.05 
 
 
658 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.54 
 
 
596 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.23 
 
 
568 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.88 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  32.26 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
337 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  31.74 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
647 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  37.61 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 
1207 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.33 
 
 
568 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
858 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
1119 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
652 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 
437 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  35.46 
 
 
1046 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  34.85 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
364 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 
1130 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
523 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 
647 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 
680 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.05 
 
 
648 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
517 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.32 
 
 
1133 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.28 
 
 
622 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
664 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 
1285 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  29.57 
 
 
969 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.15 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  30.82 
 
 
408 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  33.83 
 
 
379 aa  57.4  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
345 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.26 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35 
 
 
1080 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.22 
 
 
622 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  41.11 
 
 
553 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  32 
 
 
346 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  40.2 
 
 
364 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.5 
 
 
672 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>