186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  100 
 
 
400 aa  793    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  40.5 
 
 
350 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 
424 aa  235  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  40.45 
 
 
374 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  43.43 
 
 
362 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  40.85 
 
 
379 aa  222  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  39.88 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  40.17 
 
 
373 aa  206  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
334 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  36.31 
 
 
346 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  38.99 
 
 
364 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  39.73 
 
 
348 aa  189  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  37.25 
 
 
330 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  35.2 
 
 
336 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  37.37 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
357 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  37.07 
 
 
334 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
337 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  35.94 
 
 
335 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  33.14 
 
 
404 aa  144  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  36.91 
 
 
348 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.91 
 
 
371 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.12 
 
 
332 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  31.8 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  28.66 
 
 
397 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
373 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  38.27 
 
 
373 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  38.36 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  38.36 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  27.97 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  35.2 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.21 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 
1172 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  30.66 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  28.8 
 
 
294 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 
1046 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 
306 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  33.61 
 
 
313 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.15 
 
 
226 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  31.43 
 
 
684 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  27.17 
 
 
594 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
271 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
216 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
271 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
271 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
642 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  28.5 
 
 
513 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  29.45 
 
 
304 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.06 
 
 
596 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
315 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.93 
 
 
622 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.06 
 
 
598 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.45 
 
 
622 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.06 
 
 
723 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
597 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.41 
 
 
738 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.29 
 
 
631 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
652 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.3 
 
 
595 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  28.42 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  28.42 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.85 
 
 
577 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.47 
 
 
629 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.44 
 
 
431 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 
351 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  32.41 
 
 
381 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  31.1 
 
 
1055 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
648 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.33 
 
 
643 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 
546 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 
275 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 
203 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
664 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4600  putative adenylate/guanylate cyclase  53.19 
 
 
113 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
275 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  26.17 
 
 
528 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.65 
 
 
1123 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 
315 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  27.63 
 
 
263 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  24.12 
 
 
278 aa  50.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
1156 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
536 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.77 
 
 
354 aa  49.7  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  30.34 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  26.58 
 
 
546 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>