More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4506 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 332 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  36.68 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  35.41 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  35.57 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  33.88 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  34.74 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  39.92 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  34.65 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  34.9 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 		 424 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  31.8 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  34.41 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  31.6 
 
 		 379 aa  135  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  34.24 
 
 		 435 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.87 
 
 		 371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  31.72 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  35.15 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  30.31 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  29.12 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  30.86 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  38.95 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  39.43 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  33.16 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  39.64 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  38.61 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  33.33 
 
 		 1122 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  32.69 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.86 
 
 		 1087 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.26 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.41 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  28.37 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 859 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 515 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.43 
 
 		 703 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.79 
 
 		 1358 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.18 
 
 		 1096 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  26.92 
 
 		 684 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 		 1153 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.66 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 		 1093 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.4 
 
 		 725 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  40.87 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.32 
 
 		 591 aa  59.7  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 		 1048 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.61 
 
 		 858 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 1207 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.52 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.59 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  30.32 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  29.11 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 		 632 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  36.52 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.61 
 
 		 226 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.23 
 
 		 1291 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.64 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.62 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 1027 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 		 1138 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2195  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 		 1027 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.54 
 
 		 1089 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 		 1027 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>