More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0052 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  69.66 
 
 		 472 aa  675    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 481 aa  982    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  59.96 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  59.31 
 
 		 468 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  53.32 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 		 633 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 		 612 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  44.28 
 
 		 357 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.88 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 		 1392 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  28.88 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.31 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.11 
 
 		 696 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  34.68 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.57 
 
 		 637 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.69 
 
 		 614 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 		 903 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.76 
 
 		 1141 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  30.73 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  34.82 
 
 		 263 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.16 
 
 		 1087 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.98 
 
 		 1134 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 643 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.26 
 
 		 648 aa  67  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.49 
 
 		 638 aa  67  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  27.49 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 		 1139 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.26 
 
 		 289 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  35.4 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  32.79 
 
 		 1138 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 		 758 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 		 1151 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  32.99 
 
 		 1122 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 		 1151 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 		 1148 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.83 
 
 		 1180 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  32.33 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  32.33 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  32.33 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  31.16 
 
 		 636 aa  63.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  31.76 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.44 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  26.94 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 		 735 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 756 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  26.95 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  29.21 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.27 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  25.95 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  27.17 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  32.56 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  23.96 
 
 		 861 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0776  hypothetical protein  36.19 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  28.88 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 911 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  30.67 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 310 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.58 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.41 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 1156 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  26.09 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  31.76 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.55 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 		 759 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.17 
 
 		 737 aa  60.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.94 
 
 		 1149 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.83 
 
 		 1160 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.52 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 199 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  27.62 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 1105 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  22.73 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  24.04 
 
 		 1133 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 		 1093 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  29.93 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.07 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.86 
 
 		 764 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 		 1172 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.81 
 
 		 1089 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 		 1027 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  23.61 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  28.48 
 
 		 670 aa  57.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>