232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0410 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  100 
 
 
553 aa  1109    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.46 
 
 
631 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  52.07 
 
 
312 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  57.49 
 
 
642 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  49.41 
 
 
588 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  44.92 
 
 
648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  54.82 
 
 
652 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  57.49 
 
 
658 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  52.98 
 
 
647 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  52.35 
 
 
647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 
664 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  40.73 
 
 
667 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  48.5 
 
 
624 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  42.48 
 
 
647 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  47.37 
 
 
595 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  49.1 
 
 
598 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  49.13 
 
 
317 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  47.06 
 
 
622 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.82 
 
 
629 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  47.06 
 
 
622 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  47.93 
 
 
310 aa  150  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  46.43 
 
 
304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  44.71 
 
 
723 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.53 
 
 
738 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  42.6 
 
 
327 aa  143  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.02 
 
 
634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.71 
 
 
568 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.08 
 
 
643 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  45.4 
 
 
306 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  38.1 
 
 
603 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.37 
 
 
568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 
626 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  39.39 
 
 
581 aa  130  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  37.5 
 
 
408 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 
597 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  50.37 
 
 
150 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.58 
 
 
596 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  28.03 
 
 
607 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  29.76 
 
 
594 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 
308 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 
304 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 
315 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  28.57 
 
 
518 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
449 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
449 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
449 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
515 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  33.13 
 
 
462 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 
279 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  31.48 
 
 
404 aa  63.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
304 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
1198 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.3 
 
 
805 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 
864 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  24.12 
 
 
1392 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
680 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  33.66 
 
 
308 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 
1148 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
369 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
279 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
279 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
1151 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.56 
 
 
1037 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
1151 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.96 
 
 
1138 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 
1048 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 
295 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  37.6 
 
 
271 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  37.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
665 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
275 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  37.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.63 
 
 
1149 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
641 aa  57.4  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 
1094 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 
348 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
373 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
373 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
373 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.19 
 
 
1122 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.61 
 
 
289 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 
735 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
1142 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2252  adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 
508 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1093 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 
270 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  26.42 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  27.98 
 
 
614 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
740 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.7 
 
 
650 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
348 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  28.48 
 
 
285 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  27.91 
 
 
859 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
858 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  33.06 
 
 
379 aa  55.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  31.33 
 
 
330 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.94 
 
 
757 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>