More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0115 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 472 aa  962    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  69.66 
 
 		 481 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  58.97 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  57.91 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  52.12 
 
 		 471 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 		 612 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  46.7 
 
 		 633 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  40.09 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.71 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 		 1392 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  34.25 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.43 
 
 		 696 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  39.66 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  40.56 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.58 
 
 		 637 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.63 
 
 		 1087 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29 
 
 		 584 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.5 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0776  hypothetical protein  35.29 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 		 1180 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 		 1139 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  31.08 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  31.78 
 
 		 294 aa  67  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.93 
 
 		 797 aa  67  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 643 aa  67  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.09 
 
 		 1141 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 		 310 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 		 1172 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 903 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  24.32 
 
 		 911 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  26.49 
 
 		 701 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  32.03 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 		 1138 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.03 
 
 		 701 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.66 
 
 		 858 aa  63.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  31.02 
 
 		 636 aa  63.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  29.31 
 
 		 1134 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 1151 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 1151 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  30.39 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.52 
 
 		 753 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 1148 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.34 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.87 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.4 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  32.6 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  34.19 
 
 		 1027 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 		 1130 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  34.19 
 
 		 1027 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 		 1048 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  34.19 
 
 		 1027 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.77 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  24.18 
 
 		 1133 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  27.41 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  23.77 
 
 		 861 aa  60.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  27.75 
 
 		 1156 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  33.55 
 
 		 760 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  32.85 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  27.66 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 		 724 aa  60.1  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.85 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.63 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  28.99 
 
 		 680 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.09 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 		 1093 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.41 
 
 		 737 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.88 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  34.07 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 1105 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.08 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  29.14 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.12 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.41 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>