More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11929 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  100 
 
 
462 aa  924    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  43.52 
 
 
449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  43.52 
 
 
449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  43.52 
 
 
449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
378 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  35.61 
 
 
516 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  31.88 
 
 
514 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  30.32 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  30 
 
 
396 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  30.92 
 
 
396 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  30.71 
 
 
396 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  38.75 
 
 
680 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  35.06 
 
 
279 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
331 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
331 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.25 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
302 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  37.11 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  37.11 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.16 
 
 
1141 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.21 
 
 
643 aa  70.1  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  34.98 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
1105 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 
1037 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
1139 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  27.6 
 
 
330 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
1138 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  29.48 
 
 
306 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  37.91 
 
 
263 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30.66 
 
 
265 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  33.8 
 
 
600 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.21 
 
 
1148 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  34.94 
 
 
652 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.54 
 
 
622 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  34.51 
 
 
327 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
266 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.65 
 
 
1087 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  28.67 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  28.07 
 
 
540 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  27.04 
 
 
328 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  27.21 
 
 
328 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
1392 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 
648 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  41.09 
 
 
261 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
1065 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
1027 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
1027 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
664 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
272 aa  63.9  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.58 
 
 
634 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  27.92 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.94 
 
 
622 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.46 
 
 
738 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 
1050 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.66 
 
 
1050 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 
1027 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.92 
 
 
1149 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
296 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.35 
 
 
1023 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
284 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2490  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
277 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
1151 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
647 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
1151 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 
532 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 
647 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
266 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
299 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 
266 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 
468 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  38.17 
 
 
275 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
270 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.6 
 
 
308 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
1063 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.3 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
285 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0191  Tetratricopeptide TPR_4  27.17 
 
 
834 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.621128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
265 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
357 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>