More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0810 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
449 aa  892    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
449 aa  892    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
449 aa  892    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  43.52 
 
 
462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5761  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
378 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  37.18 
 
 
516 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 
526 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  35.38 
 
 
514 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  37.69 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  34.16 
 
 
396 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  35 
 
 
396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  39.64 
 
 
680 aa  97.8  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  36.88 
 
 
279 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 
279 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 
279 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 
647 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 
642 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
275 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
648 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 
652 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
658 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
647 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.91 
 
 
622 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  36.54 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.93 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  33.66 
 
 
1138 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.95 
 
 
595 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.87 
 
 
643 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.74 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
647 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  32.49 
 
 
1148 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
1151 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  37.59 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
1151 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  34.71 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  36.77 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  36.77 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
1156 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
597 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.36 
 
 
598 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  39.37 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.95 
 
 
629 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
1392 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0191  Tetratricopeptide TPR_4  31.35 
 
 
834 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.621128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  38.21 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 
1160 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  29.64 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
626 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
261 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.32 
 
 
1180 aa  66.6  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  36.29 
 
 
301 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 
1037 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
308 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 
1105 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.34 
 
 
723 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
300 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 
1139 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
310 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2369  transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000342435  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2490  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.12 
 
 
277 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  32.33 
 
 
481 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
312 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 
667 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.39 
 
 
1141 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 
310 aa  63.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
311 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 
275 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  32.28 
 
 
299 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  29.66 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 
295 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.43 
 
 
1149 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
1377 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.83 
 
 
624 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1780  putative adenylate/guanylate cyclase  42.05 
 
 
189 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  29.88 
 
 
313 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  31.9 
 
 
1358 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  34.78 
 
 
553 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.11 
 
 
738 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  28.22 
 
 
479 aa  60.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 
304 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
270 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 
594 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  31.91 
 
 
346 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.91 
 
 
1087 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  31.88 
 
 
277 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.35 
 
 
584 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  29.41 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 
1027 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 
1094 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>