224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1377 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  100 
 
 		 294 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  28.23 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.69 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  25.44 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  24.21 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  27.21 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  26 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  25.69 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  26.8 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 		 1392 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 612 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  23.76 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 633 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.35 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 471 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  33.06 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1918  hypothetical protein  38.53 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.968576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 472 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  37.19 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  37.19 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  37.19 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  38.83 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  28.8 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.38 
 
 		 588 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.63 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  35.35 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  41.89 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  34.96 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  31.45 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  24.67 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.66 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  26.56 
 
 		 971 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  26.71 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  31.25 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.52 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  30.41 
 
 		 603 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.09 
 
 		 1291 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.08 
 
 		 584 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.63 
 
 		 568 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  30.41 
 
 		 1358 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.08 
 
 		 584 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.15 
 
 		 568 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 		 411 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.74 
 
 		 738 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  29.46 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  25.67 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.13 
 
 		 643 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.72 
 
 		 797 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 680 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  35.05 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  31.2 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.17 
 
 		 1122 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  30.34 
 
 		 378 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 597 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  24.08 
 
 		 479 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.06 
 
 		 622 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.3 
 
 		 631 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  23.04 
 
 		 701 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 482 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 		 1048 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.27 
 
 		 1087 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  22.09 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  24.61 
 
 		 701 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 		 740 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  24.35 
 
 		 756 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  24.79 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 		 1105 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  24.79 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.06 
 
 		 622 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.31 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  31.3 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.14 
 
 		 1027 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>