239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0164 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
371 aa  720    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  48.92 
 
 
346 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  43.28 
 
 
357 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  44.98 
 
 
336 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  42.96 
 
 
334 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  42.96 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  43.16 
 
 
330 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  42.76 
 
 
348 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  41.5 
 
 
435 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  41.1 
 
 
348 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  38.54 
 
 
424 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  42.67 
 
 
334 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  37.87 
 
 
374 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  41.84 
 
 
337 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  40.88 
 
 
362 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  37.97 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  36 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  34.26 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  39.66 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 
350 aa  143  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  34.8 
 
 
404 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  36.33 
 
 
373 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  37.79 
 
 
364 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.87 
 
 
332 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  32.5 
 
 
378 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  32.4 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  42.31 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  41.54 
 
 
273 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  40.34 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  33.08 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  39.2 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.42 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.8 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  31.3 
 
 
603 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.06 
 
 
723 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.68 
 
 
226 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  28.87 
 
 
581 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  35.59 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 
308 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 
275 aa  62.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  31.54 
 
 
294 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.78 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.33 
 
 
568 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
665 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 
738 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
1180 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.01 
 
 
622 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.48 
 
 
577 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.53 
 
 
513 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 
306 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.22 
 
 
622 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 
320 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1349  sensor protein  29.66 
 
 
574 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0628361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.5 
 
 
595 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.68 
 
 
289 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
536 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.39 
 
 
631 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  41.35 
 
 
203 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 
1392 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
1046 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  35.14 
 
 
645 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
1207 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.03 
 
 
624 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
1156 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
1172 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.97 
 
 
628 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.94 
 
 
598 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
216 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  35.06 
 
 
1122 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
626 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  27.47 
 
 
684 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  37.01 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.67 
 
 
596 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  33.33 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.11 
 
 
1075 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.08 
 
 
643 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
664 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  31.72 
 
 
553 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 
351 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 
647 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 
471 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.66 
 
 
1096 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.48 
 
 
738 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 
520 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 
312 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>