More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2619 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 381 aa  775    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  36.98 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  31.59 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  31.59 
 
 		 450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 494 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  33.6 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 		 517 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  35.51 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.95 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.51 
 
 		 465 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  34.14 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  41.59 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  40.28 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  32.1 
 
 		 425 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  30.21 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  40.08 
 
 		 483 aa  146  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  29.6 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.75 
 
 		 466 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  31.75 
 
 		 424 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.36 
 
 		 500 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.92 
 
 		 614 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.35 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.51 
 
 		 860 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  36.31 
 
 		 591 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.22 
 
 		 638 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.97 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.83 
 
 		 672 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.83 
 
 		 656 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  37.7 
 
 		 632 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 		 699 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 		 859 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 861 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  33.51 
 
 		 487 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36 
 
 		 678 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.71 
 
 		 632 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  27.2 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 		 858 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 		 641 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 		 665 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  28.34 
 
 		 636 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.67 
 
 		 696 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  26.07 
 
 		 911 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  36.54 
 
 		 641 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.09 
 
 		 658 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 735 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.98 
 
 		 864 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 		 1207 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 		 746 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.4 
 
 		 650 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 		 744 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.61 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.93 
 
 		 585 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.53 
 
 		 652 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 		 726 aa  96.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  31.61 
 
 		 431 aa  96.3  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 		 364 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 		 903 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 		 758 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 		 1172 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30 
 
 		 701 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.12 
 
 		 737 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 		 479 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  31.98 
 
 		 760 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 		 607 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  33.7 
 
 		 431 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  28.9 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  29.5 
 
 		 701 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.9 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 681 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.98 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 		 759 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 469 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 643 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.79 
 
 		 694 aa  93.2  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 		 643 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 		 741 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>