More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1795 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  78.18 
 
 
439 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
440 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  55.14 
 
 
431 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  37.28 
 
 
614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  37.5 
 
 
638 aa  146  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  40.38 
 
 
607 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40.44 
 
 
903 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.43 
 
 
611 aa  136  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  40.38 
 
 
407 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
741 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.13 
 
 
701 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  38.65 
 
 
410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  39.29 
 
 
532 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  36.62 
 
 
441 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.65 
 
 
431 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  36.2 
 
 
643 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  38.84 
 
 
549 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.74 
 
 
652 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  37.68 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  33.49 
 
 
701 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  37.2 
 
 
483 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  33.49 
 
 
701 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.61 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 
734 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.82 
 
 
637 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  35.55 
 
 
735 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  39.82 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  39.42 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  37.5 
 
 
404 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
483 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.67 
 
 
758 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 
744 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.23 
 
 
737 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  33.33 
 
 
636 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  35.89 
 
 
667 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.5 
 
 
585 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  43.39 
 
 
571 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  37.77 
 
 
561 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  37.09 
 
 
702 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  38.96 
 
 
528 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  38.96 
 
 
528 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  38.96 
 
 
528 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
744 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.05 
 
 
757 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  34.07 
 
 
758 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  38.46 
 
 
971 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.1 
 
 
1207 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  36.33 
 
 
632 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
464 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  30.84 
 
 
643 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  41.41 
 
 
572 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.4 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.98 
 
 
656 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  39.8 
 
 
645 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.45 
 
 
717 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  34.07 
 
 
758 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.82 
 
 
672 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  33.18 
 
 
760 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.18 
 
 
696 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.49 
 
 
911 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  32.96 
 
 
593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.45 
 
 
656 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  38.8 
 
 
564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.95 
 
 
703 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  37.02 
 
 
645 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.28 
 
 
864 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  34.77 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.88 
 
 
504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.23 
 
 
694 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  36.9 
 
 
558 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.89 
 
 
499 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 
758 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  42.23 
 
 
572 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 
764 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
540 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  35.94 
 
 
969 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
540 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
540 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  33.97 
 
 
546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  37.39 
 
 
567 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  34.8 
 
 
488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  35.44 
 
 
541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  38.68 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 
696 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  40.86 
 
 
577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.82 
 
 
524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  37.44 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  37.87 
 
 
582 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  36.57 
 
 
859 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
699 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.71 
 
 
665 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
858 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  33.68 
 
 
729 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  34.1 
 
 
701 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.39 
 
 
657 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.18 
 
 
539 aa  113  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 
759 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>