More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4050 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  100 
 
 		 514 aa  1002    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  54.6 
 
 		 539 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  48.32 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  48.32 
 
 		 536 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  49.3 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  49.3 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  49.3 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  49.5 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  48.09 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  46.2 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3760  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  48.01 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2183  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  44.42 
 
 		 539 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000625001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  43.06 
 
 		 524 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.78 
 
 		 504 aa  300  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  38.48 
 
 		 536 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  38.89 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  38.89 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  38.89 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  38.89 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  39.51 
 
 		 549 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  43.08 
 
 		 488 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.2 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  40.79 
 
 		 494 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  38.75 
 
 		 570 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  39.46 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  41.75 
 
 		 486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  41.75 
 
 		 486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  41.75 
 
 		 486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11346  adenylate cyclase  56.59 
 
 		 217 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.306360000000001e-28  normal  0.760848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11349  adenylate cyclase  36.88 
 
 		 333 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.3765e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.31 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.68 
 
 		 636 aa  137  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.56 
 
 		 585 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  34.02 
 
 		 593 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.31 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  36.87 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  39.29 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  36.61 
 
 		 903 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 		 864 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  43.32 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 		 860 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 746 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  36.65 
 
 		 971 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.55 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.21 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.6 
 
 		 859 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.84 
 
 		 969 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.07 
 
 		 737 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  37.06 
 
 		 284 aa  110  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.12 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  36.75 
 
 		 735 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  35.12 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  38.95 
 
 		 582 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.33 
 
 		 440 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.78 
 
 		 861 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.43 
 
 		 758 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.62 
 
 		 611 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 		 696 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.07 
 
 		 858 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 		 702 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  33.94 
 
 		 607 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  37.57 
 
 		 911 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.76 
 
 		 638 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.33 
 
 		 614 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  31.08 
 
 		 645 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 		 734 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.88 
 
 		 696 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.16 
 
 		 754 aa  100  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 632 aa  99.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.98 
 
 		 672 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.71 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.96 
 
 		 744 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.03 
 
 		 701 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.37 
 
 		 656 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  40.54 
 
 		 641 aa  98.2  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 741 aa  97.8  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.96 
 
 		 658 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  35.6 
 
 		 348 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 		 645 aa  96.7  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.11 
 
 		 761 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  39.16 
 
 		 577 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  32.39 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  35.24 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.6 
 
 		 694 aa  95.5  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  35.87 
 
 		 632 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  29.96 
 
 		 717 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.51 
 
 		 758 aa  94.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 667 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.13 
 
 		 757 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 348 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.1 
 
 		 744 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.36 
 
 		 981 aa  93.6  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.03 
 
 		 678 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.05 
 
 		 936 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  28.51 
 
 		 758 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 		 536 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 		 740 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 		 723 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 		 523 aa  90.1  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>