More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3875 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  100 
 
 
499 aa  985    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  54.33 
 
 
504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  53.2 
 
 
536 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  53.8 
 
 
532 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  53.4 
 
 
528 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  53.4 
 
 
528 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  53.4 
 
 
528 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  51.2 
 
 
549 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2183  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  47.16 
 
 
539 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000625001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  49.13 
 
 
524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  42.11 
 
 
536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  40.96 
 
 
536 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  39.71 
 
 
541 aa  292  7e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  41.09 
 
 
558 aa  293  7e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  40.53 
 
 
488 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  39.51 
 
 
570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  41.86 
 
 
488 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  41.93 
 
 
539 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  40.14 
 
 
514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  40.25 
 
 
540 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  40.25 
 
 
540 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  40.25 
 
 
540 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  39.36 
 
 
567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  41.61 
 
 
494 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  42.19 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  42.19 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  42.19 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3760  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.22 
 
 
522 aa  260  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11346  adenylate cyclase  53.33 
 
 
217 aa  192  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.306360000000001e-28  normal  0.760848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.5 
 
 
529 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  35.23 
 
 
636 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 
483 aa  136  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  40.45 
 
 
864 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.5 
 
 
500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  44.83 
 
 
439 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  44 
 
 
431 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.29 
 
 
487 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.04 
 
 
585 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  36.56 
 
 
903 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 
858 aa  116  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  35.91 
 
 
607 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.89 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.87 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 
859 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.05 
 
 
701 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 
860 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.79 
 
 
284 aa  114  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  39.76 
 
 
735 aa  113  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 
861 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.04 
 
 
611 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
593 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  38.29 
 
 
746 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.9 
 
 
465 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.44 
 
 
641 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  34.2 
 
 
911 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.68 
 
 
656 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  30.77 
 
 
717 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
699 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.63 
 
 
758 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.16 
 
 
672 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  26.94 
 
 
758 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 
741 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
675 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.91 
 
 
614 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
645 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.34 
 
 
971 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  38.01 
 
 
582 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  38.55 
 
 
468 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  26.94 
 
 
758 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  27.06 
 
 
483 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  37.02 
 
 
469 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  26.67 
 
 
483 aa  99.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.85 
 
 
696 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  34.73 
 
 
591 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
523 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  32.3 
 
 
515 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.39 
 
 
764 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.34 
 
 
638 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.54 
 
 
441 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.54 
 
 
431 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  35.06 
 
 
546 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 
681 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 
969 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
1207 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  36.78 
 
 
380 aa  96.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
564 aa  96.7  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  41.43 
 
 
1160 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  43.84 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 
696 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.41 
 
 
737 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.06 
 
 
1020 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.45 
 
 
723 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  32.86 
 
 
670 aa  95.1  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.03 
 
 
703 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.86 
 
 
632 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.41 
 
 
694 aa  94.4  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.34 
 
 
657 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 
651 aa  94.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.64 
 
 
757 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.35 
 
 
656 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>