More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4218 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
468 aa  907    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  62.62 
 
 
428 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  56.16 
 
 
459 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  43.52 
 
 
437 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  42.78 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.45 
 
 
737 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.89 
 
 
650 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  37.12 
 
 
469 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  35.81 
 
 
464 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2096  adenylate/guanylate cyclase  40.51 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0716073  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  38.33 
 
 
447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.81 
 
 
622 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  36.04 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  36.41 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  36.08 
 
 
746 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  36.72 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.71 
 
 
858 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 
903 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 
735 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.57 
 
 
614 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.02 
 
 
657 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.3 
 
 
500 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  27.9 
 
 
860 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.5 
 
 
529 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.35 
 
 
696 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  34.1 
 
 
702 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.27 
 
 
670 aa  106  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  36.51 
 
 
488 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 
759 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.56 
 
 
729 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
681 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.02 
 
 
656 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 
911 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
284 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.09 
 
 
648 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  32.6 
 
 
760 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.13 
 
 
613 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 
864 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.59 
 
 
636 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.47 
 
 
764 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.85 
 
 
758 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.58 
 
 
483 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.58 
 
 
483 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 
861 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
1119 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
740 aa  103  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.54 
 
 
859 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  37.66 
 
 
488 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  29.31 
 
 
758 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.91 
 
 
518 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.71 
 
 
665 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.12 
 
 
758 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 
969 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.31 
 
 
758 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.51 
 
 
618 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.88 
 
 
513 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
515 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 
632 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  32.14 
 
 
518 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  37.26 
 
 
549 aa  100  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  38.71 
 
 
570 aa  99.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.95 
 
 
618 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.24 
 
 
628 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 
645 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  31.63 
 
 
1130 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  33.99 
 
 
635 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  30.43 
 
 
717 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  35.98 
 
 
971 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  38.14 
 
 
431 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.16 
 
 
1133 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
734 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.18 
 
 
672 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
701 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 
744 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 
741 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 
421 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  32.98 
 
 
725 aa  97.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  30.26 
 
 
358 aa  96.7  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.82 
 
 
499 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
607 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3077  diguanylate cyclase  30.43 
 
 
437 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  38.5 
 
 
592 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  38.19 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.19 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 
756 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  39.46 
 
 
574 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 
482 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.18 
 
 
656 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.22 
 
 
694 aa  95.1  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
486 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.91 
 
 
701 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
528 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
528 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  34.2 
 
 
536 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
486 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
486 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
528 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.87 
 
 
638 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>