More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3760 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3760  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  100 
 
 
522 aa  1032    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  48.23 
 
 
514 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  45.71 
 
 
539 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  43.91 
 
 
536 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  43.82 
 
 
567 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  44.02 
 
 
536 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  44.14 
 
 
540 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  44.14 
 
 
540 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  44.14 
 
 
540 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  44.47 
 
 
541 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  41.04 
 
 
558 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.82 
 
 
524 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2183  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  40.91 
 
 
539 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000625001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  39.26 
 
 
536 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  39.48 
 
 
532 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.17 
 
 
499 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  38.17 
 
 
528 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  38.17 
 
 
528 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  38.17 
 
 
528 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.7 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  39.81 
 
 
488 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  37.22 
 
 
549 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  36.03 
 
 
570 aa  229  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 
488 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  37.17 
 
 
494 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11346  adenylate cyclase  55.07 
 
 
217 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.306360000000001e-28  normal  0.760848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  36.83 
 
 
486 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  36.83 
 
 
486 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  36.83 
 
 
486 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11349  adenylate cyclase  35.81 
 
 
333 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.3765e-27  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  32.35 
 
 
636 aa  141  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
483 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.23 
 
 
529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.23 
 
 
585 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.03 
 
 
500 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.6 
 
 
487 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  38.73 
 
 
903 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.75 
 
 
611 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.39 
 
 
513 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 
641 aa  103  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  39.41 
 
 
464 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 
607 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  24.92 
 
 
483 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.12 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.12 
 
 
441 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.76 
 
 
864 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  25.1 
 
 
483 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 
593 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.68 
 
 
860 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
735 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  39.78 
 
 
431 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  33.79 
 
 
971 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.32 
 
 
861 aa  97.1  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  33.15 
 
 
645 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  35.58 
 
 
348 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 
645 aa  94.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  37.84 
 
 
439 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
696 aa  93.6  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
523 aa  93.6  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 
284 aa  93.2  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
859 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.38 
 
 
604 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  29.49 
 
 
760 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.22 
 
 
761 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.81 
 
 
678 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.64 
 
 
614 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
758 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.77 
 
 
597 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.07 
 
 
440 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  34.27 
 
 
468 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 
759 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
746 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.54 
 
 
753 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.81 
 
 
858 aa  90.1  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.69 
 
 
764 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.72 
 
 
911 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  35.23 
 
 
641 aa  89  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 
731 aa  88.6  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.64 
 
 
969 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.92 
 
 
725 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  31.33 
 
 
729 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.06 
 
 
638 aa  87  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.41 
 
 
694 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  35.33 
 
 
632 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 
794 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
591 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  34.23 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 
632 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 
756 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.43 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 
643 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
1207 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.19 
 
 
681 aa  85.1  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
744 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  39.26 
 
 
1160 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.04 
 
 
575 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.15 
 
 
696 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.33 
 
 
981 aa  84.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>