39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11349 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11349  adenylate cyclase  100 
 
 
333 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.3765e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  63.98 
 
 
558 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  65.53 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  57.59 
 
 
536 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  57.01 
 
 
536 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  56.07 
 
 
567 aa  349  5e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  55.42 
 
 
540 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  55.42 
 
 
540 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  55.42 
 
 
540 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.63 
 
 
539 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  37.29 
 
 
514 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3760  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.37 
 
 
522 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.14 
 
 
524 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2183  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.24 
 
 
539 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000625001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.89 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  26.92 
 
 
570 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  27.39 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  25.16 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  27.39 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  27.39 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  30.8 
 
 
549 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 
532 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.45 
 
 
504 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  30.09 
 
 
488 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  30.09 
 
 
488 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  26.16 
 
 
486 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  26.16 
 
 
486 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  26.16 
 
 
486 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
483 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
661 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  24.69 
 
 
494 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  31.88 
 
 
455 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
477 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>