More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6677 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  63.59 
 
 		 589 aa  725    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  62.94 
 
 		 592 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  62.77 
 
 		 592 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  100 
 
 		 577 aa  1168    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  50.28 
 
 		 574 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  47.06 
 
 		 575 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  47.06 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  46.89 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  40.77 
 
 		 564 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  39.75 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  39.67 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  37.54 
 
 		 558 aa  350  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  39.85 
 
 		 572 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 		 553 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  36.79 
 
 		 580 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  38.52 
 
 		 547 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  37.41 
 
 		 561 aa  307  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  34.99 
 
 		 586 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  38 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1968  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 		 858 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  36.21 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.9 
 
 		 645 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 		 861 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  36.21 
 
 		 407 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  36.97 
 
 		 859 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  36.6 
 
 		 614 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 		 421 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 		 641 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 		 437 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 		 701 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  34.57 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  34.04 
 
 		 483 aa  104  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 		 517 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.35 
 
 		 701 aa  103  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.05 
 
 		 638 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  30.5 
 
 		 670 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 284 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 864 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  34.15 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.22 
 
 		 797 aa  101  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  38.25 
 
 		 439 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.2 
 
 		 500 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 		 860 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4494  hypothetical protein  34.18 
 
 		 293 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.26 
 
 		 672 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.21 
 
 		 701 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 675 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  35.43 
 
 		 464 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 		 607 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  29.95 
 
 		 636 aa  98.6  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  38.19 
 
 		 367 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.76 
 
 		 737 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 740 aa  97.8  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  30.98 
 
 		 546 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.33 
 
 		 585 aa  97.4  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.76 
 
 		 656 aa  97.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.08 
 
 		 656 aa  97.1  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 759 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.85 
 
 		 757 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  39.16 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 		 903 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.99 
 
 		 696 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 794 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  34.69 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.63 
 
 		 658 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.42 
 
 		 971 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  31.34 
 
 		 645 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.1 
 
 		 758 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 367 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  32.72 
 
 		 725 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  38.16 
 
 		 488 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.2 
 
 		 657 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  28.44 
 
 		 744 aa  94  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 		 702 aa  94  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.57 
 
 		 753 aa  94  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 		 746 aa  94  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 760 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  36.99 
 
 		 431 aa  93.6  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  35.8 
 
 		 641 aa  93.6  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.19 
 
 		 723 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  33.52 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 		 399 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 		 411 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.84 
 
 		 756 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 		 370 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 		 1207 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 		 447 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.58 
 
 		 764 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 		 528 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 		 699 aa  91.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  29.51 
 
 		 358 aa  92  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 		 1805 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>